外形特征不同
1、真鳄龟：真鳄龟保持了原龟的特征，有独特的嘴、甲盾、红舌。嘴前端的上下颌呈钩状，像鹰的喙一样，极其锋利，可以咬断人的手指。甲壳边缘有许多锯齿状突起。眼睛长在嘴的两侧。它们很小，但精力充沛。头部和颈部有许多肉质突起。它的头和脚不能缩进壳里。
2、佛鳄龟：佛鳄龟外形奇特，体型庞大。它的头部呈三角形，顶部灰褐色，散布着小黑点，还有几个刺状的小突起。头部无法完全缩回壳内。乌龟的嘴缝较大，到达眼睛后部，颈部较长，颜色为淡黄色。背甲宽短，长宽几乎一样。成虫甲壳为棕色（幼虫为黑色）。每个盾片都有一个类似棘刺的突起，从棘尖向左、右、前形成放射状条纹。甲壳的后缘呈锯齿状。
分布范围不同
1.真鳄龟：巨鳄龟主要栖息于美国密西西比河流域。阿拉巴马州以南密西西比河的大部分地区。
2.佛鳄龟：主要分布于北美洲和中美洲，以美国东南部最为盛行。
生活习性不同
1.真鳄龟：真鳄龟生活在河流、湖泊、池塘和沼泽中，以鱼、水鸟、蜗牛、虾、水蛇等为食，喜欢栖息在沙地、灌木和杂草中。水。当鳄龟浮在水中时，借助甲壳上的保护色，它就像一块腐木一样漂浮，很难被发现。
2、佛鳄龟：杂食性，如野果、植物茎叶、虾、蟹、小鱼、蛆、蜗牛、蚯蚓、水蛭、小青蛙、蟾蜍、蝾螈、淡水寄生虫、小型哺乳动物及各种藻类；生活在淡水中，如湖泊、河流、沼泽和水池，也可生活在含盐量较低的咸水中，如港口和河口。
