小龙虾疾病主要分为生物因素和非生物因素两类。非生物因素引起的病害是指龙虾养殖水体缺氧、温度过高或过低、pH值过高或过低、农药等有毒有害物质污染水体等引起的病害。生物因素引起的疾病是指病毒、细菌、真菌、原虫等有害病原体引起的疾病，以及小龙虾养殖过程中因饲料不足引起的营养不良、操作不当引起的应激反应等疾病。疾病是一个复杂的生理过程，许多疾病是上述两类因素协同作用的结果。由于追求养殖效益最大化，饲养密度可能比较高，因此必须注意加强疾病预防。
在小龙虾养殖生产过程中，预防病害的措施主要包括以下几个方面：1、放养龙虾苗前，必须对池塘进行严格消毒，也就是我们常说的清塘； 2、放养将虾苗放入3-4%的食盐溶液中浸泡10分钟，对虾体进行消毒。浸泡时可以摇晃容器，以达到更好的消毒效果； 3、加强水池水质管理，定期添加新水，调整水池水质。有条件的可定期向全池撒生石灰，或定期撒光合细菌，消除养殖水中的氨氮、亚硝酸盐、硫化氢等有害物质，保持池内pH值和溶解氧水平的平衡水，并使水中的物质始终处于良性循环，解决池水老化等问题。一般在小龙虾养殖中后期每月施用一次光合细菌，每次用量为使池水达到每立方米水5-6克的浓度； 4、饲料要新鲜，不喂变质饲料。配合饲料中可添加光合细菌、免疫剂； 5、进排水口、塘脊应安装网，严格防止有害生物进入。例如，虾池内发现鲶鱼、青蛙、蟾蜍、水蛇、泥鳅、鳗鱼等，有水鼠等有害生物时，应及时采取措施消灭。
